Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRAFP15056 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRAFP15056 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRAFP15056 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRAFP15056 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRAFP15056 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRAFP15056 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BRAFP15056 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BRAFP15056 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BRAFP15056 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms