Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF35P13682 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms