Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFTRP13569 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFTRP13569 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFTRP13569 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CFTRP13569 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFTRP13569 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFTRP13569 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFTRP13569 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFTRP13569 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CFTRP13569 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFTRP13569 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFTRP13569 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CFTRP13569 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFTRP13569 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFTRP13569 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms