Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTN1P12814 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms