Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLDN11O75508 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms