Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACSL4O60488 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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