Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PDE6DO43924 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PDE6DO43924 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PDE6DO43924 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PDE6DO43924 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PDE6DO43924 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PDE6DO43924 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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PDE6DO43924 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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PDE6DO43924 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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PDE6DO43924 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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PDE6DO43924 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
PDE6DO43924 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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