Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EDIL3O43854 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms