Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC097493.2-201ENST00000468675 780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC011632.1-203ENST00000522914 454 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ZNF93-205ENST00000591366 590 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MAP3K13O43283 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms