Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FANCAO15360 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FANCAO15360 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCAO15360 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCAO15360 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCAO15360 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCAO15360 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCAO15360 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCAO15360 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCAO15360 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCAO15360 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCAO15360 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCAO15360 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCAO15360 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FANCAO15360 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCAO15360 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCAO15360 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCAO15360 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCAO15360 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCAO15360 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCAO15360 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCAO15360 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCAO15360 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms