Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EBAG9O00559 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms