Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA2O00451 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GFRA2O00451 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms