Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
B4DGG1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
B4DGG1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
B4DGG1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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