Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
SMIM1B2RUZ4 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms