Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3CA6NKF2 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms