Protein–RNA interactions for Protein: A6NEE1

PLEKHD1, Pleckstrin homology domain-containing family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHD1A6NEE1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PLEKHD1A6NEE1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms