Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EFCAB5A4FU69 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms