Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E2F8A0AVK6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms