Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC23IPQ9Y6Y8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC23IPQ9Y6Y8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms