Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A4Q9Y6R1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC4A4Q9Y6R1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A4Q9Y6R1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms