Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RAD54BQ9Y620 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAD54BQ9Y620 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAD54BQ9Y620 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms