Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SRPRBQ9Y5M8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRPRBQ9Y5M8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms