Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB4Q9Y5E5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHB4Q9Y5E5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHB4Q9Y5E5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 582.5 ms