Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00588Q9Y4M8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00588Q9Y4M8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms