Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KCNIP3Q9Y2W7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KCNIP3Q9Y2W7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms