Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V0

C15orf41, Uncharacterized protein C15orf41, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf41Q9Y2V0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C15orf41Q9Y2V0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C15orf41Q9Y2V0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C15orf41Q9Y2V0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms