Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHKBQ9Y259 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHKBQ9Y259 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHKBQ9Y259 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms