Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF24Q9UPV7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF24Q9UPV7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHF24Q9UPV7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHF24Q9UPV7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHF24Q9UPV7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms