Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN11Q9UMQ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN11Q9UMQ6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN11Q9UMQ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms