Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MED23Q9ULK4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MED23Q9ULK4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MED23Q9ULK4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms