Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRID1Q9ULK0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRID1Q9ULK0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRID1Q9ULK0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms