Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GJD2Q9UKL4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GJD2Q9UKL4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GJD2Q9UKL4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms