Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CROTQ9UKG9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CROTQ9UKG9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms