Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTBP2Q9UKA9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTBP2Q9UKA9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTBP2Q9UKA9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms