Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCAN3Q9UKA8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RCAN3Q9UKA8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RCAN3Q9UKA8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.5 ms