Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK17

KCND3, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND3Q9UK17 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCND3Q9UK17 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCND3Q9UK17 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCND3Q9UK17 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCND3Q9UK17 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms