Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCP2D1Q9UJQ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCP2D1Q9UJQ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms