Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CPA4Q9UI42 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CPA4Q9UI42 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CPA4Q9UI42 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CPA4Q9UI42 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPA4Q9UI42 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CPA4Q9UI42 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPA4Q9UI42 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPA4Q9UI42 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPA4Q9UI42 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CPA4Q9UI42 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPA4Q9UI42 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPA4Q9UI42 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CPA4Q9UI42 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms