Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
OPN4Q9UHM6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
OPN4Q9UHM6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms