Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ASIC3Q9UHC3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ASIC3Q9UHC3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms