Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.78■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
MLH3Q9UHC1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
MLH3Q9UHC1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
MLH3Q9UHC1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms