Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms