Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGXB4Q9UGU5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMGXB4Q9UGU5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGXB4Q9UGU5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms