Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
APEX2Q9UBZ4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APEX2Q9UBZ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APEX2Q9UBZ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms