Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBV2

SEL1L, Protein sel-1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1LQ9UBV2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEL1LQ9UBV2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEL1LQ9UBV2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEL1LQ9UBV2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEL1LQ9UBV2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEL1LQ9UBV2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEL1LQ9UBV2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEL1LQ9UBV2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEL1LQ9UBV2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms