Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF10DQ9UBN6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFRSF10DQ9UBN6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms