Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE7Q9UBL6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms