Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
XPR1Q9UBH6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
XPR1Q9UBH6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
XPR1Q9UBH6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms