Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SPRR3Q9UBC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPRR3Q9UBC9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms