Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHL42Q9P2K6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHL42Q9P2K6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL42Q9P2K6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms