Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH4Q9P2E8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MARCH4Q9P2E8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms